Новый метод анализа окаменевшего кала поможет точно определить его источник

Археологи во время раскопок часто находят окаменевшие фекалии. Такие находки представляют большую ценность для науки — их анализ может показать, как питались те или иные виды животных или предков человека. Кроме того, по фекалиям можно восстановить ход эволюции паразитов.

До сих пор основной проблемой для использования этих данных в научных исследованиях было отсутствие метода, который позволил бы точно определить, кому они принадлежали.

В новом исследовании ученые нашли решение этой проблемы. Они разработали платформу coproID, которая с помощью машинного обучения позволяет проанализировать ДНК хозяина и сопоставить полученные данные с геномом известных науке живых организмов.

ИИ, который лежит в основе системы, обучался на данных о микробиоме современных частиц кала собак. Тестирование метода показало, что данные о комбинации ДНК хозяина и различных колониях микробов, живущих в кишечнике людей и собак, позволяют точно различать их экскременты.

«Благодаря дополнительным данным о метагеномах кишечника незападных сельских собак, мы сможем лучше классифицировать даже более древние собачьи экскременты как фактически собачьи, а не как «неопределенные». По мере роста объема данных о микробиомах других существа мы сможем улучшить coproID и сможем помочь исследователям, которые сталкиваются с палеофазами в различных географических и исторических контекстах»

Максим Борри, ведущий автор исследования

Ранее сообщалось, что испытания атомной бомбы во время холодной войны помогли определить возраст китовой акулы. Обычным способом установить продолжительность ее жизни не удавалось — дело в том, что у акул и скатов почти отсутствуют костные структуры, отолиты.