Первые идеи о создании томской агломерации относятся к две тысячи второму году. Инициатором укрупнения областного центра изначально выступал председатель областной Думы Борис Мальцев. Позже проект создания российских агломераций существовал даже на федеральном уровне. Сергей Михальков вспомнит, какие аргументы высказывали идеологии объединения населённых пунктов. По сути дела старт "укрупнению" Томска дала реформа системы местного самоуправления, запущенная принятием в 2003 году соответствующего федерального закона. Именно тогда в современной России появились муниципальные образования. Одним из них стал Томск, в состав которого, несмотря на серьёзные протесты населения, к весне 2005 года включили, так называемые присоединённые территории: Тимирязево, Эушту, Дзержинский, Лоскутово. Власти настаивали: процесс обоюдовыгодный для всех сторон. Новый виток обсуждения темы томской агломерации случился в 2007 году. На уровне министерства регионального развития России был разработан проект создания 14 городских агломераций населением свыше 1 миллиона человек. Главный идеолог объединения Борис Мальцев предсказывал поглощение Томской области Новосибирской. Активное обсуждение продолжалось и в 2008 году. О необходимости укрупнения регионов во время своего визита в Томск говорит экс-премьер России Евгений Примаков. В областном центре создаётся рабочая группа по продвижению проекта агломерации «Большой Томск», а в девятом году между администрациями Томска и Томского района даже подписывается рамочное соглашение. Но на этом процесс останавливается. В пятнадцатом году областная администрация публикует концепцию агломерации, которая должна объединить Томск, Северск и Томский район. Предусмотрены строительство и ремонт автодорог и железнодорожных путей, создание ферм, медучреждений, детсадов и даже инновационной школы. Зимой этого года практически публично начинает обсуждаться присоединение к Томску Зонального. Сегодня на первый план при разговоре о необходимости агломерации власти выводят уже не возможное укрупнение регионов. Речь идёт, скорее, о существенном упрощении решения собственных внутренних вопросов, например, развития транспортной инфраструктуры, социальной сферы. Многие задачи будут решаться гораздо быстрее, если реально слившиеся воедино населённые пункты станут таковыми и с юридической точки зрения.